Область Крымского полуострова, так же как и прилегающая часть Черного моря, Кавказа и Балканского полуострова, испытала складчатость в конце протерозоя (рифея) и вошла в состав обширного пояса складчатой системы байкальского возраста (байкалид), которая Образовалась на всем пространстве между Восточно-Европейской и Африканской платформами. В пределах этого обширного пояса байкалид в палеозое образовались отдельные узкие геосинклинальные прогибы. Из них два таких прогиба возникли на интересующей нас сейчас площади: Добруджинско-Тарханкутский и Кавказский. Первый из них в виде пологой дуги огибал край Восточно-Европейской платформы и в своей широтной части располагался на площади современного равнинного Крыма. Второй прогиб или скорее целая система их располагалась на территории современного Большого Кавказа. Как было уже упомянуто в главе «Стратиграфия», Кавказский прогиб, возможно, продолжался в пределы современного Горного Крыма.
В результате процессов складчатости и замыкания этих прогибов на их месте в конце палеозоя образовались складчатые системы, а затем возникли горные гряды. Вместе с тем во второй половине карбона и перми .образовались впадины типа межгорных котловин заключительного этапа, которые при своем формировании перекрыли обширные пространства соседних массивов байкальского возраста. В равнинной части Крыма возникла Альминская впадина, в которой можно предполагать широкое, распространение известняков среднего карбона и перми. Не исключено, что подобная же впадина образовалась к югу от, Крыма, на месте прилегающей части Черного моря.
Все вместе — срединные массивы байкальского возраста, складчатые системы верхнего палеозоя и межгорные впадины с заполняющими их верхнепалеозойскими осадками образовали складчатое основание Скифской плиты.
К началу мезозоя складчатые системы верхнепалеозойского возраста представляли горные гряды, в которых дислоцированное основание было приподнято. Межгорные впадины и срединные массивы, частично прикрытые осадочным чехлом отложений верхнего палеозоя, представленных главным образом известняками среднего карбона и перми и, возможно, также отложениями нижнего триаса, были относительно опущены. На такого рода складчатом палеозойском субстрате развились структуры альпийского периода.